MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	A	6	6	22	27	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000853	AAT	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000853	GAT	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000853	TAG	2	6	110	115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000853	AC	3	6	126	131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_000853	CTT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_000853	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_000853	T	6	6	236	241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000853	GTT	2	6	256	261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000853	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000853	CT	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000853	TG	3	6	312	317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000853	AGGA	2	8	336	343	50 %	0 %	50 %	0 %	15642776
14	NC_000853	A	6	6	355	360	100 %	0 %	0 %	0 %	15642776
15	NC_000853	GT	3	6	376	381	0 %	50 %	50 %	0 %	15642776
16	NC_000853	CTG	2	6	525	530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
17	NC_000853	TCG	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
18	NC_000853	GTTT	2	8	544	551	0 %	75 %	25 %	0 %	15642777
19	NC_000853	ATT	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000853	GGT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000853	TTA	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000853	TTGC	2	8	1193	1200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_000853	AAACT	2	10	1240	1249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_000853	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_000853	GAAAC	2	10	1304	1313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_000853	TCA	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000853	CGTTTC	2	12	1338	1349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_000853	TCT	3	9	1387	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_000853	GCCTC	2	10	1523	1532	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_000853	CTA	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000853	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_000853	AT	5	10	1652	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000853	TTTTGT	2	12	1662	1673	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000853	GGA	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642778
35	NC_000853	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
36	NC_000853	TCT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642778
37	NC_000853	AAT	2	6	1885	1890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
38	NC_000853	AAT	2	6	1951	1956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
39	NC_000853	AAT	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
40	NC_000853	AGT	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000853	GA	4	8	2056	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000853	ACG	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000853	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000853	TCTG	2	8	2129	2136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_000853	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000853	TGA	2	6	2178	2183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000853	TGTT	2	8	2209	2216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000853	AAT	2	6	2219	2224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000853	AAT	2	6	2285	2290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000853	AAT	2	6	2352	2357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000853	ACTCGA	2	12	2375	2386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_000853	AAT	2	6	2419	2424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000853	TCC	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_000853	GTTT	2	8	2476	2483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000853	AAT	2	6	2485	2490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000853	TTCTC	2	10	2535	2544	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_000853	AAT	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000853	ACC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_000853	AAT	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000853	CCT	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_000853	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000853	GAT	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000853	TC	3	6	2939	2944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_000853	AAT	2	6	2951	2956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000853	GAC	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_000853	TGT	3	9	3004	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000853	GTTT	2	8	3072	3079	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000853	A	8	8	3101	3108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000853	G	6	6	3125	3130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000853	CTT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
71	NC_000853	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
72	NC_000853	TGGA	2	8	3212	3219	25 %	25 %	50 %	0 %	15642780
73	NC_000853	AG	3	6	3221	3226	50 %	0 %	50 %	0 %	15642780
74	NC_000853	TTTTC	2	10	3254	3263	0 %	80 %	0 %	20 %	15642780
75	NC_000853	GTGA	2	8	3270	3277	25 %	25 %	50 %	0 %	15642780
76	NC_000853	TCT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
77	NC_000853	GAT	3	9	3344	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
78	NC_000853	TCCCT	2	10	3363	3372	0 %	40 %	0 %	60 %	15642780
79	NC_000853	CT	3	6	3416	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	15642780
80	NC_000853	ATC	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
81	NC_000853	TGA	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
82	NC_000853	TCC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
83	NC_000853	GA	3	6	3486	3491	50 %	0 %	50 %	0 %	15642780
84	NC_000853	TC	4	8	3535	3542	0 %	50 %	0 %	50 %	15642780
85	NC_000853	T	6	6	3612	3617	0 %	100 %	0 %	0 %	15642780
86	NC_000853	GA	3	6	3621	3626	50 %	0 %	50 %	0 %	15642780
87	NC_000853	ACA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
88	NC_000853	CGT	2	6	3718	3723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
89	NC_000853	TTC	2	6	3728	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
90	NC_000853	GTTC	2	8	3754	3761	0 %	50 %	25 %	25 %	15642780
91	NC_000853	GAGAA	2	10	3779	3788	60 %	0 %	40 %	0 %	15642780
92	NC_000853	TTC	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
93	NC_000853	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
94	NC_000853	GTGG	2	8	3864	3871	0 %	25 %	75 %	0 %	15642780
95	NC_000853	CAA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
96	NC_000853	TAT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642780
97	NC_000853	TTC	2	6	4176	4181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
98	NC_000853	TCT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
99	NC_000853	T	7	7	4255	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	15642780
100	NC_000853	TTC	2	6	4277	4282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
101	NC_000853	TCT	2	6	4288	4293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
102	NC_000853	CG	3	6	4363	4368	0 %	0 %	50 %	50 %	15642780
103	NC_000853	TTTC	2	8	4460	4467	0 %	75 %	0 %	25 %	15642780
104	NC_000853	GAAA	2	8	4540	4547	75 %	0 %	25 %	0 %	15642780
105	NC_000853	CTT	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
106	NC_000853	T	6	6	4673	4678	0 %	100 %	0 %	0 %	15642780
107	NC_000853	GAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642780
108	NC_000853	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
109	NC_000853	TCT	2	6	4715	4720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
110	NC_000853	TCGC	2	8	4731	4738	0 %	25 %	25 %	50 %	15642780
111	NC_000853	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
112	NC_000853	TCT	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
113	NC_000853	TTC	3	9	4909	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
114	NC_000853	TTC	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
115	NC_000853	TC	3	6	4993	4998	0 %	50 %	0 %	50 %	15642780
116	NC_000853	TCC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
117	NC_000853	TCATC	2	10	5020	5029	20 %	40 %	0 %	40 %	15642780
118	NC_000853	CTT	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
119	NC_000853	CTG	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
120	NC_000853	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
121	NC_000853	CGAG	2	8	5247	5254	25 %	0 %	50 %	25 %	15642781
122	NC_000853	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
123	NC_000853	TCA	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
124	NC_000853	CCG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642781
125	NC_000853	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
126	NC_000853	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642781
127	NC_000853	CCT	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
128	NC_000853	CTTC	2	8	5637	5644	0 %	50 %	0 %	50 %	15642781
129	NC_000853	TC	3	6	5649	5654	0 %	50 %	0 %	50 %	15642781
130	NC_000853	TCT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
131	NC_000853	CCT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
132	NC_000853	ATCTC	2	10	5756	5765	20 %	40 %	0 %	40 %	15642781
133	NC_000853	TCC	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
134	NC_000853	GA	4	8	5808	5815	50 %	0 %	50 %	0 %	15642781
135	NC_000853	GCT	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642781
136	NC_000853	CTGT	2	8	5870	5877	0 %	50 %	25 %	25 %	15642781
137	NC_000853	ATC	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
138	NC_000853	AAG	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642781
139	NC_000853	AGG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642781
140	NC_000853	TCGTAT	2	12	6092	6103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15642781
141	NC_000853	GA	3	6	6109	6114	50 %	0 %	50 %	0 %	15642781
142	NC_000853	TTCACG	2	12	6119	6130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15642781
143	NC_000853	TC	3	6	6141	6146	0 %	50 %	0 %	50 %	15642781
144	NC_000853	CCT	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642782
145	NC_000853	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642782
146	NC_000853	CGT	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642782
147	NC_000853	CCA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
148	NC_000853	TC	3	6	6350	6355	0 %	50 %	0 %	50 %	15642782
149	NC_000853	GAG	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
150	NC_000853	GTT	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642782
151	NC_000853	CAC	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
152	NC_000853	CAC	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
153	NC_000853	ACC	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
154	NC_000853	TG	3	6	6711	6716	0 %	50 %	50 %	0 %	15642782
155	NC_000853	CTT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
156	NC_000853	CT	3	6	6793	6798	0 %	50 %	0 %	50 %	15642782
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160	NC_000853	TTC	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
161	NC_000853	CTT	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
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165	NC_000853	GAG	2	6	7297	7302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
166	NC_000853	CT	3	6	7313	7318	0 %	50 %	0 %	50 %	15642782
167	NC_000853	TCT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
168	NC_000853	CCT	2	6	7469	7474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_000853	TTATC	2	10	7507	7516	20 %	60 %	0 %	20 %	15642783
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177	NC_000853	GAA	2	6	7780	7785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
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179	NC_000853	GAA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
180	NC_000853	CT	4	8	7921	7928	0 %	50 %	0 %	50 %	15642783
181	NC_000853	GAA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
182	NC_000853	CAG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642783
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185	NC_000853	CGG	2	6	8192	8197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_000853	GAT	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
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188	NC_000853	CT	3	6	8352	8357	0 %	50 %	0 %	50 %	15642784
189	NC_000853	ATC	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642784
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192	NC_000853	GTA	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
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250	NC_000853	T	7	7	11401	11407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_000853	ATG	2	6	11448	11453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_000853	AAAAG	2	10	11454	11463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_000853	TGGGA	2	10	11599	11608	20 %	20 %	60 %	0 %	15642788
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262	NC_000853	GAA	2	6	12424	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642789
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269	NC_000853	AAG	2	6	12625	12630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642789
270	NC_000853	GA	3	6	12646	12651	50 %	0 %	50 %	0 %	15642789
271	NC_000853	GATC	2	8	12667	12674	25 %	25 %	25 %	25 %	15642789
272	NC_000853	CCA	2	6	12736	12741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642789
273	NC_000853	TCG	2	6	12841	12846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642789
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